Наблюдательный совет МАОУ СОШ №3 города Южно-Сахалинска является коллегиальным органом управления, осуществляющим в соответствии с Федеральным законом от 03.11.2006 №174-ФЗ «Об автономных учреждениях» решение отдельных вопросов, относящихся к компетенции автономного учреждения.

Общее собрание трудового коллектива – орган самоуправления, рассматривающий общие вопросы деятельности учреждения.  Общее собрание создается в целях выполнения принципа самоуправления, расширения коллегиальных и демократических форм управления. В состав собрания входят все работники учреждения.

Управляющий совет – это представительный коллегиальный орган государственно-общественного управления образовательной организацией, имеющий определенные Уставом МАОУ СОШ №3 города Южно-Сахалинска полномочия по решению вопросов функционирования и развития образовательной организации.

Педагогический совет является постоянно действующим органом коллегиального управления образовательной организацией, формируемым из штатных педагогических работников образовательной организации, для рассмотрения основных вопросов образовательной деятельности.